Number of the records: 1
Analýza celogenómovej genetickej informácie ako nástroj pre hodnotenie efektov šľachtenia oviec
Title Analýza celogenómovej genetickej informácie ako nástroj pre hodnotenie efektov šľachtenia oviec [elektronický zdroj] = [Whole Genome Analysis as Tool for Evaluation of Breeding Effects in Sheep] / Mária Mészárosová ; vedúci záverečnej práce Radovan Kasarda ; konzultant Gábor Mészáros Author-s Mészárosová, Mária, ; SPUFAP33 (Author)
Kasarda, Radovan, ; SPUFAP33 (Thesis advisor)Mészáros, Gábor (Thesis advisor) Corporation Slovenská poľnohospodárska univerzita (Nitra, Slovensko). Fakulta agrobiológie a potravinových zdrojov. Ústav výživy a genomiky Published 2023 Description 168 s : grafy, príl., tab. ; 30 cm Notes V práci uvedený projekt - APVV-17-0060 Genomické indikátory mimojadrovej DNA ako zdroj živočíšnej diverzity pre šľachtenie zvierat ; APVV-20-0161 Vplyv efektov šľachtenia na realizáciu genetickej premenlivosti a manifestáciu úžitkovosti a zdravia hospodárskych zvierat. Súbežný názov prevzatý z databázy uis SPU . Bibliografia s. 81-115 . Resumé anglicky, slovensky . Doktorandská dizertačná práca (PhD.).- Ústav výživy a genomiky FAPZ SPU v Nitre Subject-s pôvodná valaška zošľachtená valaška plemená ovce genetické zdroje živočíchov genómy genetická rozmanitosť šľachtenie zvierat živočíšne populácie dizertácie Annotation Autorský abstrakt: Výskum na základe genomických dát a jednonukleotidových polymorfizmov (SNP) sa stal samozrejmosťou pri chove a manažmente populácií hospodárskych zvierat. Efektívne metódy genotypovania nám umožnili pracovať s celými populáciami a použiť tieto informácie na ich lepšie riadenie. Ústredným bodom tejto dizertačnej práce boli dve slovenské národné plemená oviec, pôvodná valaška a zošľachtená valaška. Keďže sú dôležitým živočíšnym genetickým zdrojom, ale s klesajúcou veľkosťou populácie, bola vykonaná podrobná štúdia s cieľom preskúmať vplyv selekcie na ich genomickú diverzitu a šľachtenie. Dizertačná práca mala niekoľko cieľov, a to identifikovať časti genómu, ktoré boli ovplyvnené prirodzenou alebo umelou selekciou. Tieto selekčné signály boli identifikované na základe fixačného indexu, väzobnej nerovnováhy a na základe ostrovov homozygotnosti. Diverzita plemien bola hodnotená na základe genomického koeficienta inbrídingu, ale aj celkovej heterozygotnosti na autozómoch, pohlavných chromozómoch a mitochondriách. Niektoré z najdôležitejších znakov z pohľadu chovateľov (rohy, kvalita vlny a farba) boli hodnotené pomocou celogenómových asociačných štúdií. Na tieto štúdie sa použilo celkovo 97 oviec (18 samcov a 79 samíc) plemena pôvodná valaška a 69 oviec (25 samcov a 44 samíc) plemena zošľachtená valaška. Všetky ovce boli genotypované pomocou čipu GeneSeek GGP Ovine 50K. Boli identifikované selekčné signály s génmi pre produkciu mlieka, mäsa a vlny, vrátane ich kvalitatívnych charakteristík. Ďalšou významnou skupinou vo výsledkoch boli rôzne gény súvisiace so zdravím a odolnosťou voči parazitom, ktoré zdôrazňovali znaky fitness a prispôsobivosť plemien, využívaných najmä na vysokohorských pastvinách. Ako všeobecný záver práce, jednoznačne odporúčame pokračovať v aktivitách a využívaní genomických dát pre hodnotenie diverzity a manažment populácií pre tieto plemená, ako aj pre ostatné hospodárske zvieratá na Slovensku. Author’s abstract: The use of single nucleotide polymorphism (SNP) data had become commonplace in animal breeding and the management of livestock populations. The cost-effective genotyping allowed us to assess entire populations and use this information to manage them better. The central data sets of this dissertation work were two Slovakian national breeds, the Original Valachian and the Improved Valachian sheep. They are an important animal genetic resource within the country, but with decreasing population size. Therefore, a detailed study was conducted to explore the impact of selection on their genomic diversity and breeding. More specifically, the aims were to identify the patterns on the genome left behind by natural or artificial selection. These selection signatures were identified based on fixation index, linkage disequilibrium and run of homozygosity islands. The diversity of the breeds was assessed based on genomic inbreeding coefficients, but also overall heterozygosity levels on autosomes, sex chromosomes and mitochondria. Some of the most important traits from the breeders‘ perspective (horns, wool quality and color) were assessed with genome-wide wide association studies. For these studies a total of 97 sheep (18 male and 79 female) from the Original Valachian, and 69 sheep (25 male and 44 female) from the Improved Valachian populations were used, all genotyped using the GeneSeek GGP Ovine 50K chip. There were selection signatures identified with genes pointing towards all three production purposes of the Valachian sheep, milk, meat, and wool, including their quality characteristics. Another group of genes with an apparent large importance was the various traits related to health and resistance to parasites, highlighting the fitness and adaptability traits of the breed, utilised in marginal, high altitude pasture areas. As a general conclusion, we clearly recommend the continuation of activities and work with genomic data for these breeds, as well for other livestock in Slovakia. Country Slovakia Language Slovak URL http://opac.crzp.sk/openURL?crzpSigla=spunitra&crzpID=51899 Copies 1, available for regular loan 0, in-library use only 1 Database Graduate theses 
book
Call number Dislocation Collection in study room Available VP-98582 Štúrova - záverečné práce in-library use only
Number of the records: 1