Number of the records: 1
Genetická diverzita pohánky determinovaná génovo špecifickými DNA markermi
Title Genetická diverzita pohánky determinovaná génovo špecifickými DNA markermi [elektronický zdroj] = [Genetic Diversity of Buckwheat Determined by Gene Specific DNA Markers] / Maria Mravik ; vedúci záverečnej práce Želmíra Balážová Author-s Mravik, Maria (Author)
Balážová, Želmíra, ; SPUFBP31 (Thesis advisor)Corporation Slovenská poľnohospodárska univerzita (Nitra, Slovensko). Fakulta biotechnológie a potravinárstva. Ústav biotechnológie Published 2022 Description 1 online zdroj (58 s.) : ilustr., tab. Notes V práci uvedený projekt - Dopytovo-orientovaný výskum pre udržateľné a inovatívne potraviny, Drive4SIFood313011V336, spolufinancovaný zo zdrojov Európskeho fondu regionálneho rozvoja. Názov z titulnej obrazovky (stav zo dňa 30.01.2023). Súbežný názov prevzatý z databázy uis SPU . Bibliografia s. 52-58 . Spôsob prístupu: World Wide Web . Resumé anglicky, slovensky . Diplomová práca (Ing.). - Ústav biotechnológie FBP SPU v Nitre Subject-s pohánka pohánka tatárska genotypy rastlín genetická rozmanitosť SCoT markery genetické metódy diplomové práce elektronické vysokoškolské kvalifikačné práce Annotation Autorský abstrakt: Pohánka je pseudoobilnina, ktorá patrí do čeľade Polygonaceae. Pestuje sa ako tradičná plodina v Ázii, strednej Európe a východnej Európe, je používaná ako potravina ale aj ako liek. Obsahuje vysokokvalitné bielkoviny, ktoré neobsahujú lepok a sú bohaté na antioxidanty, vďaka čomu je v súčasnosti vyhľadávaná plodina. Dva druhy rodu Fagopyrum, pohánka siata (Fagopyrum esculentum Moench.) a pohánka tatárska (Fagopyrum tataricum Gaertn.) sú určené na pestovanie a ľudskú konzumáciu V diplomovej práci sme skúmali genetickú diverzitu 5 genotypov pohánky siatej a 5 genotypov pohánky tatárskej z rôznych krajín. Na analýzy sme použili 5 SCoT markerov. Spolu bolo detegovaných 81 fragmentov z ktorých 79 bolo polymorfických a 2 boli monomorfické. Počet polymorfických fragmentov bol v rozmedzí od 7 (SCoT 8) do 21 (SCoT 30) s priemerným počtom 15,8 na genotyp. Priemerná hodnota percenta polymorfizmu bola 98,91 %. Hodnoty DI mali najmenšiu hodnotu 0,828 (SCoT 8) a najväčšiu 0,980 (SCoT 29), priemerná hodnota DI bola 0,921. Hodnoty PIC mali priemernú hodnotu 0,918, kde najmenšia bola 0,819 (SCoT 8) a najväčšia 0,979 (SCoT 29). Pomocou hierarchickej klastrovej analýzu využitím UPGMA algoritmu bol vytvorený dendrogram na základe získaných fragmentov. V dendrograme vznikli dva hlavné klastre, jeden obsahoval genotypy pohánky siatej a druhy pohánky tatárskej. Každý z týchto klastrov boli rozdelený do dvoch podklastrov. Pri pohánke siatej sa vyčlenil genotyp Emka, ktorý má pôvod v Poľsku a pri pohánke tatárskej genotyp ZHAOGIAO-1, ktorý pochádza z Číny. Geneticky najbližšie genotypy pohánky siatej sú AIVA a BALLADA pochádzajúce z Litvy a Ruska. Na základe výsledkov môžeme povedať, že je SCoT technika vyhovujúca na skúmanie genetickej diverzity plodín. Jej výhodou je, že markery sú získavané z funkčnej časti genómu, a tak vieme pomocou SCoT techniky priamo sledovať hospodársky významné znaky vo výskume, ako aj v šľachtiteľskom procese. Author’s abstract: Buckwheat is a pseudo-cereal that belongs to the family Polygonaceae. It is grown as a traditional crop in Asia, Central Europe and Eastern Europe, it is used as a food but also as a medicine. It contains high-quality gluten-free proteins and is rich in antioxidants, making it a sought-after crop. Two species of the genus Fagopyrum, common buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench) and tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum Gaertn) are intended for cultivation and human consumption. We used 5 SCoT markers for analyses. A total of 81 fragments were detected, of which 79 were polymorphic and 2 were monomorphic. The number of polymorphic fragments ranged from 7 (SCoT 8) to 21 (SCoT 30) with an average of 15.8 per genotype. The average percentage of polymorphism was 98.91 %. The DI values had the lowest value of 0.828 (SCoT 8) and the largest 0.980 (SCoT 29), the average value of DI was 0.921. PIC values averaged 0.918, with the smallest being 0.819 (SCoT 8) and the largest 0.979 (SCoT 29). Using hierarchical cluster analysis using the UPGMA algorithm, a dendrogram was created based on the obtained fragments. Two main clusters were created in the dendrogram, one containing the genotypes of common buckwheat and the other types of tartary buckwheat. Each of these clusters was divided into two subclusters. The Emka genotype, which originates in Poland, was singled out for the common buckwheat, and the ZHAOGIAO-1 genotype, which comes from China, was singled out for the tartary buckwheat. The genetically closest genotypes of common buckwheat are AIVA and BALLADA originating from Lithuania and Russia. Based on the results, we can say that the SCoT technique is suitable for studying the genetic diversity of crops. Its advantage is that the markers are obtained from the functional part of the genome, so we can use the SCoT technique to directly monitor economically important traits in the research as well as in the breeding process Country Slovakia Language Slovak URL http://opac.crzp.sk/openURL?crzpSigla=spunitra&crzpID=54195 Copies [1] Database E-resources (online) book
Call number Dislocation Collection in study room Available O-5237
Number of the records: 1