Number of the records: 1
Vplyv toku génov na štruktúru genómu retríverov
Title Vplyv toku génov na štruktúru genómu retríverov [elektronický zdroj] = [Effect of gene flow on the structure of the retriever genome] / Oliver Sič ; vedúci záverečnej práce Nina Moravčíková ; konzultant Radovan Kasarda Author-s Sič, Oliver (Author)
Moravčíková, Nina, ; SPUFAP33 (Thesis advisor)Kasarda, Radovan, ; SPUFAP33 (Thesis advisor) Corporation Slovenská poľnohospodárska univerzita (Nitra, Slovensko). Fakulta agrobiológie a potravinových zdrojov. Ústav výživy a genomiky Published 2022 Description 1 online zdroj (65 s.) : ilustr., tab. Notes V práci uvedený projekt - APVV-17-0060 Genomické indikátory mimojadrovej DNA ako zdroj živočíšnej diverzity pre šľachtenie zvierat a APVV-20-0161 Vplyv efektov šľachtenia na realizáciu genetickej premenlivosti a manifestáciu úžitkovosti a zdravia hospodárskych zvierat. Názov z titulnej obrazovky (stav zo dňa 14.12.2022). Súbežný názov prevzatý z databázy uis SPU . Bibliografia s. 56-65 . Spôsob prístupu: World Wide Web . Resumé anglicky, slovensky . Diplomová práca (Ing.). - Ústav výživy a genomiky FAPZ SPU v Nitre Subject-s diplomové práce elektronické vysokoškolské kvalifikačné práce Annotation Autorský abstrakt: Cieľom diplomovej práce bolo analyzovať genetickú diverzitu retríverov a vplyv toku génov na štruktúru ich genómu. Na porovnanie bolo využitých šesť populácií plemien hladkosrstý retríver, kučeravý retríver, labradorský retríver, retríver z Nového Škótska, retríver zo zálivu Chesapeake a zlatý retríver a ako kontrolnú skupinu sme použili vlka dravého, ich divého predka. Všetkých 250 jedincov bolo genotypovaných pomocou genotypizačného čipu CanineHD. Vyhodnocovaná bola celková heterozygotnosť, efektívny počet alel, Wrightove fixačné indexy, molekulová variancia, genetická vzdialenosť, analýza základných komponentov, analýza stupňa premiešaná a intenzita genetickej migrácie. V rámci heterozygotnosti bola u všetkých populácií zistená hodnota nižšia ako 0,5, čo značí vyšší podiel homozygotných genotypov v ich genofonde. Najvyššiu mieru diverzity preukázala populácia labradorského retrívera (Ho=0,386 a He=0,386) a naopak najnižšiu populácia vlka dravého. Aj pri efektívnom počte alel a fixačnom indexe boli najvyššie hodnoty zistené pre populáciu labradorského retrívera (ENA=1,741 a FIS=0,020). Hodnota FIS sa v rámci všetkých populácií pohybovala blízko k nule čo indikuje, že boli v Hardy-Weinbergovej rovnováhe. Analýza molekulovej variancie ukázala, že najviac genetickej variability v súbore ovplyvnili rozdiely medzi jedincami v rámci plemien (82%). Z pohľadu genetických vzdialeností za najpodobnejšie možno označiť plemená labradorský a zlatý retríver. Analýza základných komponentov rozdelila populácie do piatich samostatných genetických skupín, pričom súčasne indikovala vplyv labradorského retrívera na genofond hladkosrstého retrívera. Pri hodnotení genetického premiešania výsledky preukázali, že genofond hladkosrstého retrívera významne ovplyvnilo aj plemeno zlatý retríver (29,9%), čo potvrdila aj pozorovaná miera intenzity toku génov medzi testovanými populáciami. Author’s abstract: The aim of the thesis was to analyze the genetic diversity of retrievers and the influence of gene flow on the structure of their genome. Six breed populations of Flat Coated Retriever, Curly Retriever, Labrador Retriever, Nova Scotia Retriever, Chesapeake Bay Retriever, and Golden Retriever were used for comparison, and Gray Wolf, their wild ancestor, was used as a control group. All 250 individuals were genotyped using the CanineHD genotyping chip. Total heterozygosity, effective allele number, Wright fixation indices, molecular variance, genetic distance, principal component analysis, degree of admixture analysis, and genetic migration intensity were evaluated. In terms of heterozygosity, all populations were found to have a value less than 0.5, indicating a higher proportion of homozygous genotypes in their gene pool. The highest level of diversity was shown by the Labrador retriever population (Ho=0.386 and He=0.386) and conversely the lowest population of Gray Wolf. Also for the effective number of alleles and fixation index, the highest values were found for the Labrador retriever population (ENA=1.741 and FIS=0.020, respectively). The FIS value was close to zero across all populations indicating that they were in Hardy-Weinberg equilibrium. Analysis of molecular variance showed that most of the genetic variability in the set was influenced by differences between individuals within breeds (82%). In terms of genetic distances, the Labrador and Golden Retriever breeds were the most similar. Principal component analysis divided the populations into five separate genetic groups, while simultaneously indicating the influence of the Labrador Retriever on the Flat Coated Retriever gene pool. When assessing genetic mixing, the results showed that the gene pool of the Flat Coated Retriever was significantly influenced by the Golden Retriever breed (29.9%), which was confirmed by the observed intensity of gene flow between the tested populations. Country Slovakia Language Slovak URL http://opac.crzp.sk/openURL?crzpSigla=spunitra&crzpID=54394 Copies [1] Database E-resources (online) 
book
Call number Dislocation Collection in study room Available O-4010
Number of the records: 1