Number of the records: 1
Skríning genotypov ľanu siateho (Linum usitatissimum L.) vo vzťahu k obsahu lignanov stres-senzitívnymi markérmi na báze mikroRNA
Title Skríning genotypov ľanu siateho (Linum usitatissimum L.) vo vzťahu k obsahu lignanov stres-senzitívnymi markérmi na báze mikroRNA [elektronický zdroj] = [Screening of Flax (Linum usitatissimum L.) Genotypes in Relation to Lignan Content by MicroRNA-Based Stress-Sensitive Markers] / Angéla Hodosy Vargaová ; vedúci záverečnej práce Katarína Ražná Author-s Hodosy Vargaová, Angéla, ; SPUFAP31 (Author)
Ražná, Katarína, ; SPUFAP31 (Thesis advisor)Corporation Slovenská poľnohospodárska univerzita (Nitra, Slovensko). Fakulta agrobiológie a potravinových zdrojov. Ústav rastlinných a environmentálnych vied Published 2023 Description 97 s. : grafy, ilustr., tab. ; 30 cm Notes V práci uvedený projekt - Dopytovo-orientovaný výskum pre udržateľné a inovatívne potraviny Drive4SIFood313011V336 a projektu ITMS: 313011V344 Dlhodobý strategický výskum prevencie, intervencie a mechanizmov obezity a jej komorbidít . Bibliografia s. 86-97 . Resumé anglicky, slovensky . Doktorandská dizertačná práca (PhD.).- Ústav rastlinných a environmentálnych vied FAPZ SPU v Nitre Subject-s lignany ľan siaty odrody genotypy rastlín miRNA (nukleová kyselina) genetické markery polymorfizmus adaptácia rastlín abiotický stres šľachtenie rastlín dizertácie Annotation Autorský abstrakt: Ľan je viacúčelová rastlina s dlhou históriou. Dôležitou zložkou ľanu sú sekundárne metabolity, ako omega-3 mastné kyseliny, lignany a vláknina, ktoré sú pre ľudské zdravie prospešné. Viaceré štúdie poukazujú na významný potenciál ľanu siateho ako perspektívneho zdroja pre funkčné potraviny a potravinové doplnky - nutraceutiká. Viaceré štúdie deklarujú, že genóm ľanu siateho sa vyznačuje adaptačným potenciálom voči abiotickým podmienkam prostredia. Epigenetické mechanizmy majú kľúčovú úlohu v schopnosti rastlín prispôsobiť sa prostrediu počas stresových podmienok. Molekuly miroRNA patria svojim regulačným potenciálom k epigenetickým mechanizmom regulácie transkripčných faktorov a génov podieľajúcich sa na adaptačno-obranných mechanizmoch rastlín. Neoddeliteľnou súčasťou spomínaného adaptačného potenciálu ľanu siateho sú aj lignany, ktorých biosyntéza je na významnej úrovni regulovaná molekulami mikroRNA. Cieľom práce bol genomický skríning odrôd ľanu siateho olejného typu, pre účely selekcie genotypov s potenciálom adaptácie voči abiotickým podmienkam stresu, na základe profilácie zastúpenia a aktivity stres-senzitívnych markérov mikroRNA. Uvedený skríning bol realizovaný v prepojení na obsahové zastúpenie lignanov v jednotlivých genotypoch, ako látok s antioxidačným potenciálom, ktoré sa podieľajú na environmentálnej adaptácii genómu ľanu siateho. Genomický skríning genotypov sa realizoval v podmienkach in vitro indukovaného stresu malnutrície a v poľných podmienkach, kde bol rastlinný materiál odoberaných v rôznych rastových fázach. Pre identifikáciu vhodných typov stres-senzitívnych markérov na báze sekvencií mikroRNA, bolo použitých deväť genotypov ľanu siateho, typu olejného, ktoré boli analyzované desiatimi typmi miRNA markérov. Na základe ich profilácie, boli do ďalšieho výskumu vybrané markéry miR168, miR172, miR395, miR398 a miR408. Z hľadiska skríningu polymorfizmu a charakterizácie genotypov, bol najefektívnejší markér miR168, pomocou ktorého bol zaznamenaný najvyšší počet amplifikovaných miRNA lokusov. Profilácia tohto markéra bola najvýraznejšia vo fáze tvorby stoniek a najnižšia počast tvorby kvetných pukov. Pri odrode Agram, s najvyšším obsahom SECO (6248 mg.kg-1), bolo pozorované najnižšie zastúpenie markéra miR168 v podmienkach indukovaného nutričného stresu. Zísakné výsledky potvrdzujú stanovené hypotézy nášho výskumu. Author’s abstract: Flax is a multipurpose plant with a long history. An important component of flax is secondary metabolites, such as omega-3 fatty acids, lignans and fiber, which are beneficial for human health. Several studies point to the significant potential of flax seed as a promising source for functional foods and food supplements - nutraceuticals. Several studies declare that the flax genome is characterized by an adaptive potential towards abiotic environmental conditions. Epigenetic mechanisms have a key role in the ability of plants to adapt to the environment during stressful conditions. Due to their regulatory potential, miroRNA molecules belong to the epigenetic mechanisms of regulation of transcription factors and genes involved in adaptation-defense mechanisms of plants. Lignans, whose biosynthesis is significantly regulated by microRNA molecules, are an integral part of the aforementioned adaptation potential of linseed. The aim of the work was the genomic screening of flax varieties of the sown oil type, for the purpose of selecting genotypes with the potential of adaptation to abiotic stress conditions, based on the profiling of the representation and activity of stress-sensitive microRNA markers. The mentioned screening was carried out in connection with the content representation of lignans in individual genotypes, as substances with antioxidant potential, which participate in the environmental adaptation of the flax genome. Genomic screening of genotypes was carried out in conditions of in vitro induced malnutrition stress and in field conditions, where the plant material was collected in different growth phases. In order to identify suitable types of stress-sensitive markers based on microRNA sequences, nine genotypes of oil-seeded flax were used, which were analyzed by ten types of miRNA markers. Based on their profiling, miR168, miR172, miR395, miR398 and miR408 markers were selected for further research. In terms of polymorphism screening and genotype characterization, the most effective marker was miR168, which recorded the highest number of amplified miRNA loci. The profiling of this marker was the most pronounced in the stage of stem formation and the lowest tribute of flower bud formation. In the Agram variety, with the highest SECO content (6248 mg.kg-1), the lowest representation of the miR168 marker was observed under conditions of induced nutritional stress. The obtained results confirm the established hypotheses of our research. Country Slovakia Language Slovak URL http://opac.crzp.sk/openURL?crzpSigla=spunitra&crzpID=43850 Copies 1, available for regular loan 0, in-library use only 1 Database Graduate theses book
Signatúra Dislokácia Umiestnenie Voľné VP-98572 Štúrova - záverečné práce len prezenčne
Number of the records: 1