Number of the records: 1
Proteomická analýza semien parazitických rastlín z čeľade Orobanchaceae
Title Proteomická analýza semien parazitických rastlín z čeľade Orobanchaceae / Juraj Kleman ; školiteľ Radoslava Matúšová ; školiteľ špecialista Katarína Klubicová Author-s Kleman, Juraj, ; SPUFBP31 (Author)
Matúšová, Radoslava (Thesis advisor)Klubicová, Katarína (Thesis advisor) Corporation Slovenská poľnohospodárska univerzita (Nitra, Slovensko). Fakulta biotechnológie a potravinárstva. Ústav biotechnológie Published 2022 Description 151 s. : ilustr., tab. ; 30 cm Notes V práci uvedený projekt - AgroBioTech ITMS 26220220180, VEGA 2/0138/17 Štúdium vybraných fyziologických a molekulárnych parametrov zahrnutých v regenerácii a raste parazityckých burín Phelipanche spp. . Bibliografia s. 99-151 . Resumé anglicky, slovensky . Doktorandská dizertačná práca (PhD.). - Ústav biotechnológie, FBP SPU v Nitre (v práci uvedené Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV) Subject-s Striga hermonthica zárazovec konáristý zárazovité parazitické rastliny semená klíčenie rastlín rastlinné bielkoviny chromatografická analýza proteomika dizertácie Annotation Autorský abstrakt: Parazitické druhy rastlín, ktoré ovplyvňujú poľnohospodárske plodiny, spôsobujú obrovské ročné agro-ekonomické straty. Škody spôsobené nimi bránia dlhodobej a efektívnej poľnohospodárskej produkcii a ohrozujú aj potravinovú bezpečnosť v mnohých svetových regiónoch. Orobanchaceae je čeľaď parazitických a neparazitických rastlín, ktoré sú zodpovedné za takéto škody na poľnohospodárskych poliach na celom svete. Vyvinul sa u nich efektívny spôsob parazitizmu. Tieto rastliny produkujú veľké množstvá drobných semien, ktoré zostávajú životaschopné v pôde po mnoho rokov a tak sú schopné ohroziť poľnohospodársku výrobu v relatívne veľkom meradle a na pomerne dlhú dobu. Ich semená majú tendenciu klíčiť len za priaznivých podmienok, keď sú schopné vďaka chemickému signálu, častokrát strigolaktónov, detegovať vo svojom blízkom okolí prítomnosť vhodného hostiteľa.Takýto neobyčajný proces klíčenia je potenciálne jednou z najdôležitejších fáz ich životného cyklu, a preto si vyžaduje dôkladné objasnenie. Na tento účel sme vybrali dvoch poľnohospodársky významných predstaviteľov tejto čeľade, ktorých sme skúmali na proteomickej úrovni, konkrétne Striga hermonthica (Delile) Benth. a Phelipanche ramosa (L.) Pomel. Pri druhu Striga hermonthica sme analyzovali dormantné semená a zvolili sme kombinovaný prístup využívajúci techniku SDS-PAGE spojenú s chromatografickou metódou a hmotnostnou spektrometriou. Celkovo sme identifikovali 57 proteínov v týchto dormantných semenách. Pri druhu Phelipanche ramosa sme na analýzu použili klíčiace semená. Analyzovali sme predklíčené semená, ktoré sú schopné detegovať chemický signál na spustenie svojho klíčenia, a semená 12 hodín a 24 hodín po aplikácii stimulantu klíčenia, syntetického analógu strigolaktónov – GR24. Využili sme metódu 2D-PAGE spojenú s hmotnostnou spektrometriou. Celkovo sme detegovali 107 rôznych proteínových škvŕn, z ktorých 13 malo zmenenú abundanciu počas týchto skorých štádií klíčenia. Týchto 13 proteínových škvŕn sme následne identifikovali a charakterizovali. Author’s abstract: Parasitic plant species, which affect agricultural crops, cause immense annual yield losses. Damages caused by them challenge the feasibility of long-term farming operations, and also threaten the food security in many regions of the world. Orobanchaceae is a family of parasitic, and non-parasitic, plants that are a cause of such damages to agricultural fields worldwide. They have evolved quite a prolific way of parasitism. These plants are capable of jeopardizing entire agricultural operations on a large scale and for a long term due to their capability to produce large quantities of minute seeds that remain viable in the soil for many years. Their seeds only tend to germinate under favourable conditions when they are able to detect the presence of a suitable host in their immediate vicinity due to a chemical signal, often strigolactones. It can be argued that their rather uncommon germination is one of the most important stages of their life cycle and therefore warrants being thoroughly elucidated. For this purpouse, we have selected two of the most notorious members of this family, Striga hermonthica (Delile) Benth. and Phelipanche ramosa (L.) Pomel, to analyse them on a proteomic level. For Striga hermonthica we used dormant seeds and selected a combined approach using gel-based SDS-PAGE technique coupled with gel-free technique interfaced with mass spectrometry. In total, we identified 57 proteins in dormant seeds. For Phelipanche ramosa we selected germinating seed for our analysis. We used preconditioned seeds, capable of perceiving chemical signal to trigger germination, and seeds 12 hours and 24 hours respectively, after being stimulated by a germination stimulant, synthetic strigolactone analogue – GR24. We utilized 2D-PAGE method coupled with mass spectrometry. In total, we have detected 107 different protein spots, out of which 13 were differently abundant during these early stages of germination. We subsequently identified and characterized these 13 protein spots Country Slovakia Language Slovak URL http://opac.crzp.sk/openURL?crzpSigla=spunitra&crzpID=29095 Copies 1, available for regular loan 0, in-library use only 1 Database Graduate theses 
book
Call number Dislocation Collection in study room Available VP-97748 Štúrova - záverečné práce in-library use only
Number of the records: 1