Mikroorganizmy predstavujú najväčšie nebezpečenstvo v ich patogenite a v možnosti vyvolať u hostiteľa ochorenie. Ďalšími faktormi sú toxicita, alergenita a iné biologické efekty. Mikroorganizmy podľa patogenity sa zaraďujú do 4 rizikových skupín. Riziká, že využívanie geneticky modifikovaných organizmov by mohlo mať škodlivé následky na životné prostredie, sa musia objektívne zhodnotiť. Preto molekulárni biológovia musia pokračovať vo výskume a zoznamovať verejnosť srizikami a výhodami geneticky modelovaných organizmov a súčasne žiadať ich priebežné testovanie.